Wesley Sneijder sinh trong 1gia đình có truyền thống bóng đá: bố là cầu thủ, anh trai Jeffrey thi đấu cho Stormvogels Telstar và em trai Rodney chơi cho đội trẻ Ajax.

Sneijder cưới Ramona Streekstra vào ngày 18 tháng 6 năm 2005. Họ có một con trai, Jessey, ra đời vào ngày 4 tháng 9 năm 2006. Tuy nhiên hai người đã li dị vào ngày 21 tháng 1 năm 2009.[32]

Ngày 8 tháng 5 năm 2008, Sneijder đã ngăn cản em trai mình là Rodney chuyển đến thi đấu cho Real Madrid "Real Madrid muốn có được chữ ký của em trai tôi, và cậu ấy rất vui khi biết được thông tin đó. Tuy nhiên tôi không ủng hộ chuyện những cầu thủ trẻ sớm, vì vậy tôi bảo Rodney rằng, điều đầu tiên mà em phải làm vào lúc này là tiếp tục hoàn thiện mình trong màu áo Ajax."